鹭江出版社坚持“为人民服务，为经济建设服务，为祖国统一大业服务”的办社宗旨，立足特区、面向全国、辐射两岸、融入“一带一路”，组织出版了大量为特区两个文明建设服务的图书；充分发掘地方出版资源，发挥地域优势，出版了有关港、澳、台地区及东亚、东南亚周边国家的经济、文化及社会生活方面的图书，形成了自己的特色。先后出版了《海外华文文学史》、《四库全书》、“中国西藏视点丛书”（5卷）、“亚太经济丛书”（12册）、“厦门文化丛书”（26册）、《梁实秋文集》（15卷）、《传世汉文琉球文献辑稿》（60卷）、《妈祖文献整理与研究丛刊》（20卷）等，有400多种图书在全国各级图书评奖活动中获奖。
1997年《特区经济丛书》获得第三届国家图书奖提名奖
1998年《香港文学史》获第十一届中国图书奖
2000年《金门史稿》获第十二届中国图书奖
2001年《林则徐》获第八届“五个一工程”一本好书奖
2007年《天堂没有路标》获第十届“五个一工程”一本好书奖
2013年《城里城外》获第四届中华优秀出版物奖提名奖
2018年《中国历史上的腐败与反腐败》获第四届中国出版政府奖提名奖